Unter dem Dach der Diakonie Kork wurden die beiden Epilepsiekliniken 1999 im Rahmen einer Unternehmensreform als eigenständiger Geschäftsbereich unter dem Namen "Epilepsiezentrum Kork" vereint. Es umfasst die Epilepsieklinik für Kinder und Jugendliche, die Epilepsieklinik für Erwachsene sowie die Séguin-Klinik für Menschen mit schwerer geistiger Behinderung, die Intensiv-Monitoring-Einheit, das Blutspiegellabor sowie verschiedene Therapieabteilungen. Für 106 Patienten besteht die Möglichkeit zur stationären Aufnahme. Etwa 6000 Patienten werden durch die Epilepsieambulanzen ambulant betreut

Seit Anfang 2009 sind die Epilepsiekliniken zertifiziert.